张新杰的blog

说明：本系统测试环境为centos4.3，并且以获得mpich2-1.0.5p4.tar.gz软件包。假设你的mpich2-1.0.5p4.tar.gz软件包已经下载到/root/目录下。以root用户登录。要求会使用vi文本编辑器修改文件。下面以四台pc为例。


准备工作：设置IP，更改主机名为node01,node02,node03,node04.


一、创建SSH信任连接（在root目录下）


1、更改/etc/hosts文件
#vi /etc/hosts 打开hosts文件，更改如下：


127.0.0.1 localhost.localdomain localhost
node01的IP scc-m(可以不做)
node01的IP node01
node02的IP node02
node03的IP node03
2、在node01生成SSH秘钥对.
#ssh-keygen -t rsa 一路回车即可
产生.ssh文件,
#ls -a 查看是否有.ssh文件夹

3、进入.ssh目录
#cd .ssh


4、生成authorized_keys文件
#cp id_rsa.pub authorized_keys


5、退出到root目录
#cd ..


6、建立本身的信任连接
#ssh node01 按提示输入yes（三个字母要打全）


7、设置node02（node02的root目录下）
#ssh-keygen -t rsa 生成.ssh文件夹
#scp node01的IP：/root/.ssh/* /root/.ssh 拷贝node01上的.ssh文件夹覆盖本地的
#scp node01的IP：/etc/hosts /etc/hosts 拷贝node01上的hosts文件覆盖本地的
#ssh node01 提示处输入yes回车


设置node03的方法与node02相同


8、确认3台机器的信任连接已建立
对每个节点执行：
#ssh node01
#ssh node02
#ssh node03
在提示处输入yes回车，最后确定无需输入密码并且没有任何提示信息即可登陆（”Last login:时间日期”提示信息除外）



二、安装MPICH2(在节点root目录下)


1、解压缩
#tar -zxvf mpich2-1.0.1.tar.gz
或者 #gunzip -c mpich2-1.0.1.tar.gz|tar xf mpich2-1.0.1.tar


2、创建安装目录
#mkdir /usr/MPICH-instsll


3、进入mpich2解压目录
#cd mpich2-1.0.1


4、设置安装目录
#./configure --prefix=/usr/MPICH-install


5、编译
#make


6、安装
#make install


7、退出到root目录
#cd ..


8、通过编辑.bashrc文件修改环境变量
#vi .bashrc
修改后的.bashrc文件如下：


# .bashrc


# User specific aliases and functions
PATH=”$PATH:/usr/MPICH-install/bin” 新增加的


#Source .bashrc


9、测试环境变量设置
#which mpd
#which mpicc
#which mpiexec
#which mpirun


10、修改/etc/mpd.conf文件，内容为secretword=myword
#vi /etc/mpd.conf


设置文件读取权限和修改时间
#touch /etc/mpd.conf
#chmod 600 /etc/mpd.conf


11、创建主机名称集合文件/root/mpd.hosts
#vi mpd.hosts


文件内容如下：
node01
node02
node03
三、测试


1、本地测试
#mpd & 启动
#mpdtrace 观看启动机器
#mpdallexit 退出


2、通过mpd.hosts运行集群系统
#mpdboot -n number -f mpd.hosts number为要起动的机器个数
#mpdtrace
#mpdallexit



3、测试运行MPICH的例子程序
#mpdboot -n 4 -f mpd.hosts 启动4台机器
#mpiexec -n number /usr/MPICH-install/examples/cpi number为使用的进程数
#mpdallexit


4、如果测试不能通过，请进行第四步



四、问题解决


1、通过mpdcheck获得一写帮助信息
#mpdcheck -pc

2、查错
#mpdcheck -l


3、通过mpd.hosts文件查错
#mpdcheck -f mpd.hosts 如果无错误
#mpdcheck -f mpd.hosts -ssh


4、如果上述无错误，可略过此步
对任意两台机器进行查错
m1: #mpdcheck -s 输出主机名host和端口port
m2: #mpdcheck -c host port


注意：以上四步都是在没有运行mpd的情况下进行的


5、mpd查错
m1: #mpd -e & 返回使用的端口
m2: #mpd -h m1 -p echoed_port_m1 &


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